Le troisième grand volet du Contrat de Rivière regroupe des actions liées à la préservation de la ressource en eau. Dans certains secteurs du bassin, il s'agit de concilier prélèvements (pour l'eau potable, l'irrigation) et préservation de l'environnement. D'autres actions permettront d'améliorer la gestion et la qualité de la ressource en eau potable (réhabilitation de réseaux d'alimentation, unités de traitement, périmètres de protection de captages).
Enfin, une partie des financements sera utilisée pour mettre en place et maintenir une politique globale et cohérente de gestion de l'eau à l'échelle du bassin : actions de communication et de sensibilisation, mise en place de suivis, postes d'animation.